この度環境省は、大規模な災害が起きたときには、飼い主は原則ペットを連れて避難するとしたうえで、日頃から避難に必要な1週間分程度のペットフードや水を備蓄したり、ペットが避難所でほかの避難者に危害を加えないようしつけを行ったりすることなどを求めています。
災害時におけるペット救護ガイドライン (環境省)
とてもページ数が多いですが、一度目を通しておいてください。
ペットは飼育している人にとっては家族ですが、そうでない人にとっては厄介扱いを受けます。
そのような事のないように日頃からクレートトレーニングをしたり、人や他の動物と馴染めるように遊んでおく事をお勧めします。